2013年，香港科技大学计划招收的内地本科生人数为150人，相比2012年招生人数的151人，招生人数稍有减少。中国教育在线资料显示，香港科技大学2013年至2014年学费也将从2012年至2013年的10万港元涨至12万港元，学费涨幅为20%左右。

　　2013年，香港科技大学在内地独立招生不参加全国普通高校招生计划，不占高考志愿，以择优方式录取。